中国科学院上海有机化学研究所于1985年7月被批准建立博士后流动站，现有2个国家重点实验室、4个院重点实验室，分别为：生命有机化学国家重点实验室、金属有机化学国家重点实验室、中国科学院有机氟化学重点实验室、中国科学院天然产物有机合成化学重点实验室、中国科学院有机功能分子合成与组装化学重点实验室和中国科学院能量调控材料重点实验室。此外，还有同国内外大学、企业联合共建的，如沪港化学合成联合实验室、宁波新材料创制中心等多个联合研究中心。设站至今，已有近500名有志于有机化学工作的青年科研人员进入上海有机所博士后流动站，先后获得中国博士后基金委、中科院、上海市的各项科研资助和奖励近200项。

上海有机所博士后工作由人力资源处负责，包括办理博士后进出站手续、户口申请、博士后科学基金及各项资助申报、博士后经费管理、博士后联谊会联络等，并负责联络上级主管部门和兄弟单位等。

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